داستان از آن جا شروع می شود که شما به کمپ Task Force 141 می روید و در نقش "Soap" امتحان می دهید تا در گروه قبول شوید و در آن جا با "Captain Price" و "Nikolai" آشنا می شوید. پس از انجام امتحان،به ماموریّتی در کشتی می روید. در این جا داستان شروع می شود،شخصی به نام "Makarov" گروهی تروریستی دارد و در حال جمع آوری نیرو برای به وجود آوردن جنگ است.خالد ال اسد اسلحه ای به سمت ***** شلیک می کند،و او را می کشد که یک تروریست است.الب است که یک تروریست چطور توانسته یک ***** را همراه ارتشش شکست دهد،آمریکایی ها برای جلوگیری از قدرتمند تر شدن خالد ال اسد به مرکز تلویزیونی او حمله می کنند.
حال نیکولای جاسوس جهانی،تحت اسارت نیروهای خالد ال اسد است و تیم کاپیتان پرایس طی یک عملیات او را نجات می دهد.نیکولای محل خالد ال اسد را می داند و تیم کاپیتان پرایس به آن جا می روند،در همین حین،عملیات آمریکایی ها با شکست مواجه می شود و به شهری می روند تا آن جا را پاک سازی کنند،امّا نیروهای خالد،بمب هسته ای را در شهر رها می کنند که 30000 هزار سرباز آمریکایی در آن جا می میرند،پرایس در روستایی است که خالد ال اسد در آن جا است،عملیات انجام و خالد ال اسد می میرد و در تماسی تلفنی،پرایس کلمه ی زاکائف را می فهمد و می فهمد که او در قبل می خواسته او را بکشد،ولی او زنده مانده.
تیم پرایس تحت محاصره ی نیروهای ایمران زاکائف قرار می گیرد،و با کمک نیروهای خودی موفّق به فرار می شوند و حال هدف آن ها پیدا کردن زاکائف است.طی جریاناتی،تیم کاپیتان پرایس،و آمریکایی ها،نقشه های زاکائف را برهم می زنند،آن ها از دست نیروهای زاکائف فرار می کنند،هلیکوپترها مسیر آن ها را می بندند و پل را خراب می کنند،سپس زاکائف وارد می شود،همه بر روی زمین افتاده اند،زاکائف و دو سرباز که در کنارش ایستاده اند،تیم را می کشند،کاپیتان پرایس بر روی زمین افتاده و توان جنگیدن ندارد،اسلحه را به طرف شما پرت می کند و شما زاکائف را می کشید،در این هنگام،نیروهای روسی می رسند و شما را می برند و بازی به پایان می رسد.