بخش اوّل «جزیره ی غریب»:
شما Jason Brody هستید،به همراه برادر بزرگتر و کوچکترتان و 3 تن از دوستانتان به جزیره های استوایثی می روید،ولی از این بی خبرید که دزدان دریایی در آن منطقه فعالیّت می کنند،در طی یک حادثه،دزدان دریایی شما را می گیرند.در این هنگام با شخصیّت Vass آشنا می شوید.واس "Vass" رهبر دزدان دریایی است و شما را زندانی می کند،شما به همراه برادر بزرگترتان فرار می کنید،ولی برادر بزرگترتان می میرد.
سپس شما فرار می کنید و در آب می پرید،وقتی به هوش می آیید،خودتان را در اتاقی در کنار یک نفر می بینید،او یک نفر از جنگجویان Rakyat است و به شما در آشنا شدن با طبیعت کمک می کند.حال شما قصد دارید تا دوستانتان را نجات دهید و از آن جزایر بروید.